その90日の間にseedがめっちゃ手に入るイベントをやる！
わけないです

たぶんSEEDを没収しないのではなくて、装備やアイテムなどでSEEDを使っちゃって没収できないのかもしれません。
そしてSEEDで買い占めたアイテムや装備はTOM行きですかね・・・。
たまに「出）SEED　求）NP」とかの看板も見かけましたから、RMTする人もいたでしょうね。

自分はTOM否定派なので（RTMは犯罪だと思っているので）、これを機に公式RMT認定制度を見直して欲しいものです。
（TOM嫌ならモエンに行けと言われましたが、鯖統合する前からオル鯖でやってたのでモエンなんてありませんよっ。）

まず引用。
3.　高レベル向け新ダンジョン「夜明けの塔」実装記念イベントを開始しました。
2)　夜明けの塔を攻略せよ！最多討伐キャンペーン
　　【概要】
　　　新規実装された「夜明けの塔」にて、ハードモードのBOSSを討伐した数が多いサーバー順に、
　　　報酬を配布します。
　　　是非この機会に、サーバー内の仲間と力を合わせて、夜明けの塔を攻略しましょう！
　　【期間】
　　　2013年12月18日（水）メンテナンス後 ～ 2014年1月22日（水）メンテナンス前まで
　　　※ 報酬配布は、上記イベント期間終了後の実施を予定しております。

5.　「経験値蓄積」イベントを開始しました。
　　【概要】
　　　自分のキャラクターを最大限まで育てたプレイヤーのために、
　　　「夜明けの塔」プレイ時獲得する経験値を記録できる「経験の古文書」を配布するイベントを実施します。

ま、金を取る不正を行ったんだから、その処罰が妥当だと思うが、

これは仕様上そうするしかないってことだと思ってる。